有机肥主要来源于植物和(或)动物施于土壤以提供植物营养为其主要功效的含碳物料.经生物物质、动植物放弃物、植物残体加工而来，消除了其中的有毒有害物质，富含大宗有益物质，

它包括：多种有机物质、肽类以及包括氮、磷、钾在内的富厚的营养元素。不但能为农作物提供全面营养，并且肥效长，可增加和更新土壤有机质，增进微生物滋生，改善土壤的理化性质和生物活性，是绿色食品生产的主要养分。

广义上的有机肥：俗称农家肥，包括以种种动物、植物残体或代谢物组成，如人畜粪便、秸秆、动物残体、屠宰场放弃物等。

生物菌肥(微生物肥料)是以微生物的生命运动导致作物获得特定肥料效应的一种制品，是农业生产中使用肥料的一种。其在我国已有近50年的历史，从根瘤菌剂——细菌肥料——微生物肥料，从名称上的演变已说明我国微生物肥料逐步生长的历程。 恒久以来，社会上对微生物肥料的看法保存一些误解和偏见。

一种看法认为它肥效很高，把它当成万能肥料，甚至扬言可以完全取代化肥
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另一种看规则认为它基础不是肥料。

其拭魅这两种都是偏见。海内外多年试验证明，用根瘤菌接种大豆、花生等豆科作物可提高共生固氮效能，确实有增产效果，合理应用其它菌肥拌种或施用微生物肥料，对非豆科农作物也有增产效果，并且有化肥达不到的效果。因此，我们认为它是肥料，又与古板化肥和有机肥在看法和内涵上差别。

微生物肥料是活体肥料，它的作用主要靠它含有的大宗有益微生物的生命运动来完成。

只有当这些有益微生物处于旺盛的滋生和新陈代谢的情况下，物质转化和有益代谢产品才华不绝形成。

因此，微生物肥料中有益微生物的种类、生命运动是否旺盛是其有效性的基础，而不像其它肥料是以氮、磷、钾等主要元素的形式和几多为基础。正因为微生物肥料是活制剂，所以其肥效与活菌数量、强度及周围情况条件密切相关，包括温度、水分、酸碱度、营养条件及原生活在土壤中土着微生物排斥作用都有一定影响，因此在应用时要加以注意。